RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 RGS11O94810 467 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TCRBP04435 133 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 PPIAL4GP0DN37 164 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 SLC6A1P30531 599 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 CR1LQ2VPA4 569 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF841Q6ZN19 808 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OR1L1Q8NH94 360 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TERB2Q8NHR7 220 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 RFESDQ8TAC1 157 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 UBALD1Q8TB05 177 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OR2S2Q9NQN1 319 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 SLC2A8Q9NY64 477 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 VWC2LB2RUY7 222 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 FOXH1O75593 365 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFB6O95139 128 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 DHFRP00374 187 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 RLN1P04808 185 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 LIPFP07098 398 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF735P0CB33 412 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF728P0DKX0 622 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 FPR2P25090 351 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 NFYBP25208 207 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 BTCP35070 178 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 CEACAM6P40199 344 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 FXYD4P59646 89 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 HTD2P86397 168 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF273Q14593 569 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OXA1LQ15070 435 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 Q5PR19 223 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OR10A7Q8NGE5 316 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 GIMAP1Q8WWP7 306 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TOMM40LQ969M1 308 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OCEL1Q9H607 264 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 NUDT15Q9NV35 164 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 GNG12Q9UBI6 72 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 JPT1Q9UK76 154 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C15orf65H3BRN8 121 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ENSAO43768 121 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 PPYP01298 95 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-43DP0DP04 118 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 CCL3L1P16619 93 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OMGP23515 440 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 S100GP29377 79 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 LUMP51884 338 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 HERPUD1Q15011 391 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 PLA1AQ53H76 456 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C5orf24Q7Z6I8 188 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OR52L2PQ8NGH6 319 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 CREB3L1Q96BA8 519 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 MMP28Q9H239 520 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ONECUT1Q9UBC0 465 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 F2RL2O00254 374 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 FCN3O75636 299 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 SPNP16150 400 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 AADACP22760 399 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 LMO4P61968 165 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 LCN2P80188 198 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf88Q6PI97 169 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms