RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 SLC22A20A6NK97 555 aa16.2■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 UCP1P25874 307 aa16.2■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 SHBQ15464 509 aa16.2■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 OR4F4Q96R69 305 aa16.19■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 SLC25A22Q9H936 323 aa16.19■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.18■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 TP53I11O14683 189 aa16.18■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 FAM78BQ5VT40 261 aa16.18■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 TNFSF10P50591 281 aa16.17■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 PAM16Q9Y3D7 125 aa16.17■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 IL3RAP26951 378 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 OR5I1Q13606 314 aa16.16■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.16■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 A0A0U1RQK1 487 aa16.16■□□□□ 0.18
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PRPF39-201ENST00000355765 FASLGP48023 281 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 OR8B8Q15620 311 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 PLCXD3Q63HM9 321 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 CACNG5Q9UF02 275 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 EXPH5Q8NEV8 1989 aa16.16■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 TCF21O43680 179 aa16.15■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 GNG10P50151 68 aa16.15■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
PRPF39-201ENST00000355765 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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