RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 MMP24Q9Y5R2 645 aa15.95■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NRASP01111 189 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SOD3P08294 240 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFB7P17568 137 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SERPINA2P20848 420 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF266Q14584 549 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 OR51T1Q8NGJ9 327 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TAAR6Q96RI8 345 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 KNG1P01042 644 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 CXCL1P09341 107 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 FGF7P21781 194 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SARAFQ96BY9 339 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM68Q96MH6 324 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.94■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SMCO3A2RU48 225 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PLP2Q04941 152 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 HNF4GQ14541 408 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF506Q5JVG8 444 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 BORCS8Q96FH0 119 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 CYYR1Q96J86 154 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TM2D1Q9BX74 207 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PITPNC1Q9UKF7 332 aa15.93■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 DUSP1P28562 367 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 DLK1P80370 383 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 GUSBP1Q15486 140 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 OR2T2Q6IF00 324 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 C1orf87Q8N0U7 546 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PIGCQ92535 297 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM225BP0DP42 221 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 FHITP49789 147 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RND2P52198 227 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF429Q86V71 674 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PECRQ9BY49 303 aa15.92■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MED12LQ86YW9 2145 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ST8SIA3O43173 380 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SCGB1D2O95969 90 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ERVFRD-1P60508 538 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 FAM214BQ7L5A3 538 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MDP1Q86V88 176 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 C9orf106Q8NAJ2 232 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 METTL9Q9H1A3 318 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.91■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 CYB5BO43169 146 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ANGPTL7O43827 346 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 HBE1P02100 147 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 APLNRP35414 380 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 FUT6P51993 359 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MALLQ13021 153 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM187Q14656 261 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TECTBQ96PL2 329 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SYT3Q9BQG1 590 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A31Q9H0C2 315 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NAA60Q9H7X0 242 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 A8MWP6 167 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TCAPO15273 167 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 HSPA12AO43301 675 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NGFP01138 241 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms