RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 SRXN1Q9BYN0 137 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 DBX1A6NMT0 343 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CLN5O75503 358 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 IGLV3-19P01714 112 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 QRFPP83859 136 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 KCNMB1Q16558 191 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 OR5A2Q8NGI9 324 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 SLC22A20A6NK97 555 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 FGF12P61328 243 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TWSG1Q9GZX9 223 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 Q9N2K0 584 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM178AQ8NBL3 297 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 GGACTQ9BVM4 153 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CDIPTO14735 213 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CD5P06127 495 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CFPP27918 469 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 UCP3P55916 312 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 C3AR1Q16581 482 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 PHYHD1Q5SRE7 291 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 SLC35E3Q7Z769 313 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM147Q9BVK8 224 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TCFL5Q9UL49 500 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 SELEP16581 610 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 PMELP40967 661 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CFHR1Q03591 330 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 FAM78BQ5VT40 261 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM54Q969K7 222 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 TAAR6Q96RI8 345 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 PITPNC1Q9UKF7 332 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 H0Y980 276 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 GPR146Q96CH1 333 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 PSG11Q9UQ72 335 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRU-201ENST00000345512 C5orf63A6NC05 138 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SYNGR1O43759 233 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CCL1P22362 96 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 Q3ZCU0 254 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 VSTM5A8MXK1 200 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CTDSP1Q9GZU7 261 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 DVL1O14640 695 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 PCOLCEQ15113 449 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CEACAM21Q3KPI0 293 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 FUT9Q9Y231 359 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 LTBRP36941 435 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 IQCJQ1A5X6 159 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CALHM1Q8IU99 346 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 EDARADDQ8WWZ3 215 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 COL4A3Q01955 1670 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 PAGE4O60829 102 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 PGA5P0DJD9 388 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SSPNQ14714 243 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 ESPL1Q14674 2120 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 FCGR3BO75015 233 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 G6PCP35575 357 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SERF2P84101 59 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 HIKESHIQ53FT3 197 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 S1PR3Q99500 378 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 J3QT63 122 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 M0R1X1 148 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 AQP7O14520 342 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 MAGEA5P43359 124 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 DBX2Q6ZNG2 339 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 ABHD14BQ96IU4 210 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRU-201ENST00000345512 WFDC1Q9HC57 220 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms