RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 H3BUI4 141 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CTDSP2O14595 271 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 RANBP1P43487 201 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GNMTQ14749 295 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF626Q68DY1 528 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ABCG5Q9H222 651 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PSG11Q9UQ72 335 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ODF3BA8MYP8 253 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ORC5O43913 435 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SSX5O60225 188 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ARG1P05089 322 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FCER2P06734 321 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SCTP09683 121 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ELK1P19419 428 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FPR2P25090 351 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GNG10P50151 68 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GUCA2AQ02747 115 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ARFRP1Q13795 201 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TEX29Q8N6K0 151 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 Q9N2K0 584 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 A0A087X0M5 115 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1B0GX30 115 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINE3A8MV23 424 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 F2RL2O00254 374 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SLC31A2O15432 143 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 VENTXO95231 258 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 IGLV1-47P01700 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FCGR3AP08637 254 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CD3GP09693 182 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF134P52741 427 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HMGN3Q15651 99 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 C6orf183Q5T699 404 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HACD4Q5VWC8 232 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SPINT2O43291 252 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 XRCC3O43542 346 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM127O75204 238 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CD34P28906 385 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HERPUD1Q15011 391 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FAM189A2Q15884 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PLA1AQ53H76 456 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 LAX1Q8IWV1 398 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PHF21AQ96BD5 680 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 DIABLOQ9NR28 239 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 J3QR06 171 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV4-59P01825 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-DQB1P01920 261 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 APOA1P02647 267 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SOX6P35712 828 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 RAB13P51153 203 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R20P59543 309 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 BPIFB3P59826 476 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SSX2Q16385 188 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MIDNQ504T8 468 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 IGSF11Q5DX21 431 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR52W1Q6IF63 320 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms