RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 OCM2P0CE71 109 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 GZMHP20718 246 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SSTR5P35346 364 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CDK5R1Q15078 307 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 Q3ZCU0 254 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RDH10Q8IZV5 341 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 NEK6Q9HC98 313 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 PARP11Q9NR21 331 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RYR1P21817 5038 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 HSPB6O14558 160 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TNFAIP8O95379 198 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 MT-ND2P03891 347 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CAPGP40121 348 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ZNF137PP52743 207 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RAB40BQ12829 278 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 MMDQ15546 238 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TTC23Q5W5X9 447 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 FAHD1Q6P587 224 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RFT1Q96AA3 541 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SLC29A1Q99808 456 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CST11Q9H112 138 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 KMT2AQ03164 3969 aa7.96□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 A0A1W2PN81 502 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SHISA3A0PJX4 238 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 METTL15A6NJ78 407 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SULT1C4O75897 302 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ANXA8P13928 327 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ZNF20P17024 532 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 CHRNA7P36544 502 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SETD9Q8NE22 299 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 TMEM106AQ96A25 262 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SPACA5Q96QH8 159 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 RETNQ9HD89 108 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 KIAA1456Q9P272 454 aa7.96□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 NUPR2A6NF83 97 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SLC16A6O15403 523 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 RGS11O94810 467 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ZP3P21754 424 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 IL13RA2Q14627 380 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ELP2Q6IA86 826 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 LCN12Q6JVE5 192 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 LIN54Q6MZP7 749 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 FGGYQ96C11 551 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 RNF150Q9ULK6 438 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.95□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 NBR2O15453 112 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ORC5O43913 435 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 SOX15O60248 233 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ISG15P05161 165 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 OR2T7P0C7T2 308 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 TMEM225BP0DP42 221 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 CD40LGP29965 261 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ACTBP60709 375 aa7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
USP41-201ENST00000292729 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms