RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	ACTBL2	Q562R1	376 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	CADM3	Q8N126	398 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	CCDC107	Q8WV48	283 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	C22orf46	C9J442	243 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	FCER2	P06734	321 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF735	P0CB33	412 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	GZMK	P49863	264 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	GNB2	P62879	340 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB39B	Q96DA2	213 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	TGFA	P01135	160 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	NPY4R	P50391	375 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ESCO2	Q56NI9	601 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	MCUB	Q9NWR8	336 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A0B4J293	547 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780		A8MXK9	166 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	NDUFB6	O95139	128 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	HLA-DMA	P28067	261 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	OR56B4	Q8NH76	319 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780		Q9N2K0	584 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	NUDT15	Q9NV35	164 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF273	Q14593	569 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	OR52W1	Q6IF63	320 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780		M0QYG6	137 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	GPR37	O15354	613 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	LCN2	P80188	198 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	PAX2	Q02962	417 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780		Q6ZS49	121 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	BEST4	Q8NFU0	473 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	POM121C	A8CG34	1229 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	CGB3	P0DN86	165 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	CGB7	P0DN87	165 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	HRH1	P35367	487 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	GLP1R	P43220	463 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TAS2R46	P59540	309 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	CR1L	Q2VPA4	569 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	DISC1	C4P0D8	188 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	AMY2A	P04746	511 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	TATDN3	Q17R31	274 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	UBALD1	Q8TB05	177 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC6A7	Q99884	636 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	PRRT1	Q99946	306 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C7orf66	A4D0T2	115 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C12orf77	C9JDV5	145 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	C15orf65	H3BRN8	121 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	CCL3L1	P16619	93 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	SSTR5	P35346	364 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	CORO2A	Q92828	525 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FAM53B-201	ENST00000280780	MMP26	Q9NRE1	261 aa		18.36	■□□□□ 0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms