RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 OR4A5Q8NH83 315 aa7.86□□□□□ -1.15
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PTPRB-201ENST00000261266 COL10A1Q03692 680 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRB-201ENST00000261266 OR10J1P30954 320 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRB-201ENST00000261266 CSRP2Q16527 193 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 PRR27Q6MZM9 219 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 DPF1Q92782 380 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 COA4Q9NYJ1 87 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 EML2O95834 649 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 CCL4P13236 92 aa7.84□□□□□ -1.15
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