RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 IL19Q9UHD0 177 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM210A6NLX4 147 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 HAX1O00165 279 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TRGC1P0CF51 173 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 HTRA3P83110 453 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC00596Q86U02 117 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FGF14Q92915 247 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TEX37Q96LM6 180 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 GUCD1Q96NT3 240 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PDLIM7Q9NR12 457 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PSMB11A5LHX3 300 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 J3QR06 171 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CTAG2O75638 210 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ABLIM3O94929 683 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MT-ND6P03923 174 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 DAOP14920 347 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MFAP2P55001 183 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 GGTLC2Q14390 218 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PMCHL1Q16048 86 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CCL4L1Q8NHW4 92 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRC61Q9BV99 259 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MMP25Q9NPA2 562 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MMP9P14780 707 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TM4SF4P48230 202 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NUMA1Q14980 2115 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SPRED3Q2MJR0 410 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 IGSF11Q5DX21 431 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CHODLQ9H9P2 273 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MYH3P11055 1940 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A1B0GV72 72 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 METTL12A8MUP2 240 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 GALNSP34059 522 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 B4GALNT1Q00973 533 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ALG14Q96F25 216 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FIZ1Q96SL8 496 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A1W2PQM1 296 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 C7orf71A4D174 169 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 H3BRM9 83 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 CCL21O00585 134 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC25A17O43808 307 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR2A4O95047 310 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 GPX1P07203 203 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PSG6Q00889 435 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 TEX30Q5JUR7 227 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 GAPTQ8N292 157 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 GPBAR1Q8TDU6 330 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 OR2A7Q96R45 310 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 NTMQ9P121 344 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 MYH7P12883 1935 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A0B4J2E0 115 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-215ENST00000624145 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms