RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623706.3

ATRX-212, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 2

Gene ATRX, Length 7,245 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-212ENST00000623706 OR52N5Q8NH56 324 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 GLMPQ8WWB7 406 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ZNF479Q96JC4 524 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 FEVQ99581 238 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 LPAR4Q99677 370 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CUX1P39880 1505 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 GFRA2O00451 464 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SFT2D2O95562 160 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 GPX1P07203 203 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 AQP6Q13520 282 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 IHHQ14623 411 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SPINK9Q5DT21 86 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 WDR82Q6UXN9 313 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 IRF2BP1Q8IU81 584 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 AMN1Q8IY45 258 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 H3BMG7 143 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 H3BQ15 152 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PAX4O43316 350 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PPP1R3DO95685 299 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TCRBP04435 133 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CXCL8P10145 99 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 MTNR1AP48039 350 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SSR4P51571 173 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 BACE1P56817 501 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 DGCR2P98153 550 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 EGR3Q06889 387 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 NNATQ16517 81 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 GUSBP11Q6P575 273 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PRNTQ86SH4 94 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SPSB4Q96A44 273 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 C16orf92Q96LL3 132 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 IL36BQ9NZH7 164 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 LACTBL1A8MY62 500 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 NPIPB9F8W1W9 429 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CELA3AP09093 270 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 OR9G9P0C7N8 305 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ZNF250P15622 560 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TMEM99Q8N816 258 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 IQCF6A8MYZ5 107 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TISP43B9A030 160 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TMPRSS2O15393 492 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 LHBP01229 141 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 GYPCP04921 128 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.923e-7■■□□□ 12.8
ATRX-212ENST00000623706 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ZNF85Q03923 595 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PMAIP1Q13794 54 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ZNF345Q14585 488 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 PIGZQ86VD9 579 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 SYNJ1O43426 1573 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ZBTB42B2RXF5 422 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 COX7A2LO14548 114 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 FOXL2P58012 376 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 CENPWQ5EE01 88 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-212ENST00000623706 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.04□□□□□ -1.92
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