RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 OR51B6Q9H340 312 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 H0Y980 276 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 M0R036 132 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SLC34A2O95436 690 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MEOX2P50222 304 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SULT1A1P50225 295 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TUBA4BQ9H853 241 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 HS3ST1O14792 307 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1-39P01597 117 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1D-39P04432 117 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 WDR86Q86TI4 376 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RDH5Q92781 318 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01387J3KSC0 135 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IL18BPO95998 194 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 VDAC1P21796 283 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RNF212Q495C1 297 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZRM9 215 aa11.36□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CHST1O43916 411 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MT-ND4LP03901 98 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CBR1P16152 277 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF266Q14584 549 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 NEK7Q8TDX7 302 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 APH1AQ96BI3 265 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD14BQ96IU4 210 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DDA1Q9BW61 102 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IFNA4P05014 189 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 FBP1P09467 338 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DS4P43632 304 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RAB5BP61020 215 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DS1Q14954 304 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MKXQ8IYA7 352 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2CO00762 179 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PSG2P11465 335 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RAB5AP20339 215 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 F2RP25116 425 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 Q6P435 159 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 GPR146Q96CH1 333 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SPIN2AQ99865 258 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 GP6Q9HCN6 339 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 HLA-DRB3P79483 266 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RHEBQ15382 184 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DCAF10Q5QP82 559 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PR80 420 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS44E7EML9 344 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 H3BP45 60 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SYNGR4O95473 234 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ICAM4Q14773 271 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 VASH2Q86V25 355 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR51H1Q8NH63 302 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IL22RA2Q969J5 263 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR51I2Q9H344 312 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.34□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MT-CO3P00414 261 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CA6P23280 308 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TESK1Q15569 626 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR2T2Q6IF00 324 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 LFNGQ8NES3 379 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZPBPQ9BS86 351 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 C12orf49Q9H741 205 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.33□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV2-5P01817 119 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SRP19P09132 144 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 CEACAM1P13688 526 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 IL24Q13007 206 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms