RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 GZMHP20718 246 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 DUSP1P28562 367 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TNFSF8P32971 234 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 MNDAP41218 407 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 P2RX3P56373 397 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 BPIFB3P59826 476 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 PITPNAQ00169 270 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 EDDM3AQ14507 147 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 PDCD1Q15116 288 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 C6orf183Q5T699 404 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OR52W1Q6IF63 320 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZTK2 550 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LAX1Q8IWV1 398 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A28Q96A46 364 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 RAB3CQ96E17 227 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SEH1LQ96EE3 360 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 PPA2Q9H2U2 334 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CTSZQ9UBR2 303 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 HSF4Q9ULV5 492 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.42□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ODAMA1E959 279 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 HSPB6O14558 160 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SPINT2O43291 252 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CD3GP09693 182 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OR3A1P47881 315 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 VEGFCP49767 419 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CLDN12P56749 244 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ERVFRD-1P60508 538 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 QRFPP83859 136 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 GUCA2AQ02747 115 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 UNC119Q13432 240 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 Q6P435 159 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM104Q8NE00 496 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 NANPQ8TBE9 248 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF714Q96N38 554 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 GFI1Q99684 422 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SRRQ9GZT4 340 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CHST6Q9GZX3 395 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OPN4Q9UHM6 478 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 AUP1Q9Y679 476 aa6.41□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PP11 408 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SHISA3A0PJX4 238 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM82A0PJX8 343 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM30A4D0T7 59 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CTDSP2O14595 271 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LDLRAD4O15165 306 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 PSPNO60542 156 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 PFDN1O60925 122 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TPPPO94811 219 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 TOX4O94842 621 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 FSHBP01225 129 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 HLA-DQB1P01920 261 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms