RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162		Q9N2K0	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	FBN2	P35556	2912 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	FLNC	Q14315	2725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	CR1	P17927	2039 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A0A6YYH2	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PRD5	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PRF3	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PRM7	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		A6NJ64	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		H7C1Q1	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MGST3	O14880	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM127	O75204	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	NAPSA	O96009	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LPL	P06858	475 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MELTF	P08582	738 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SPN	P16150	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RFX2	P48378	723 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PPP5C	P53041	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF45	Q02386	682 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KLRD1	Q13241	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		Q8N402	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PNKD	Q8N490	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MED30	Q96HR3	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	BET1	O15155	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC31A2	O15432	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PLA2G10	O15496	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FABP7	O15540	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RBBP9	O75884	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SCGN	O76038	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HBZ	P02008	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CD3D	P04234	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	COX7A1	P24310	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PAX6	P26367	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	GNG10	P50151	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DLX6	P56179	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARF6	P62330	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PITPNA	Q00169	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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