RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 C1QCP02747 245 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 FAM74A3Q4VXF1 159 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 HES3Q5TGS1 186 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR4C12Q96R67 309 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 AP5S1Q9NUS5 200 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 DTX4Q9Y2E6 619 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 FAM74A7A6NL05 159 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 FAM157AC9JC47 383 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CCL3P10147 92 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM50BP56557 158 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 GUCA2BQ16661 112 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TINAGQ9UJW2 476 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MOGAT3Q86VF5 341 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 SPINT1O43278 529 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf40Q8IXQ3 194 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR5A2Q8NGI9 324 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR2W1Q9Y3N9 320 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF716A6NP11 495 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 DDTP30046 118 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 PAGE4O60829 102 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 GGTLC2Q14390 218 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF788Q6ZQV5 615 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR2M3Q8NG83 312 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR52L2PQ8NGH6 319 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 UFC1Q9Y3C8 167 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PRD5 423 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PRF3 423 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PRM7 423 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 PTP4A3O75365 173 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF343Q6P1L6 599 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ABHD3Q8WU67 409 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR4A8P0C604 315 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 IER3P46695 156 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 GABRA6Q16445 453 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 HSPB8Q9UJY1 196 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 SNURFLB1AK76 121 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 PSG2P11465 335 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35E3Q7Z769 313 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CHST5Q9GZS9 411 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ACP1P24666 158 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf17Q8NAS9 161 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CDK2AP1O14519 115 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 IFITM3Q01628 133 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 FOCADQ5VW36 1801 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ERVH48-1M5A8F1 160 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CCL4P13236 92 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF345Q14585 488 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 HIKESHIQ53FT3 197 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TNFSF18Q9UNG2 199 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 GAGE10A6NGK3 116 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 GAB4Q2WGN9 574 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 HOGA1Q86XE5 327 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 PDE6DO43924 150 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 KIR3DL2P43630 455 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD55Q3KP44 614 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 RFLNBQ8N5W9 214 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 NRIP2Q9BQI9 281 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 COA4Q9NYJ1 87 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 R4GN57 208 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TRIP11Q15643 1979 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GU03 582 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 P01737 135 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV39A0A0B4J263 110 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR2T8A6NH00 312 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 PLP1P60201 277 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35E4Q6ICL7 350 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 RAB1BQ9H0U4 201 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CORTO00230 105 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 KCNAB3O43448 404 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 NPTNQ9Y639 398 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 LAMB2P55268 1798 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 J3QT63 122 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 CDS2O95674 445 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 MRGPRGQ86SM5 289 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 OR4A4PQ8NGN8 299 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF721Q8TF20 911 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1D-16P01601 117 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 FAM157CP0CG43 387 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM255AQ5JRV8 349 aa18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms