RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 EXTL1Q92935 676 aa9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ADAM20O43506 726 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 CCNOP22674 350 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 VAMP2P63027 116 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 SRPXP78539 464 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.77□□□□□ -0.84
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GGA3-205ENST00000578348 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.77□□□□□ -0.84
GGA3-205ENST00000578348 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa9.77□□□□□ -0.84
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GGA3-205ENST00000578348 SCTP09683 121 aa9.77□□□□□ -0.85
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GGA3-205ENST00000578348 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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GGA3-205ENST00000578348 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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GGA3-205ENST00000578348 PROB1E7EW31 1015 aa9.76□□□□□ -0.85
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GGA3-205ENST00000578348 CCL2P13500 99 aa9.75□□□□□ -0.85
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GGA3-205ENST00000578348 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 CCL11P51671 97 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 MALSU1Q96EH3 234 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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