RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5H6Q8NGV6 325 aa27.04■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OMGP23515 440 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52W1Q6IF63 320 aa27.03■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM133Q9H2Q1 129 aa27.02■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf183Q5T699 404 aa27.01■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PNKDQ8N490 385 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A38Q96DW6 304 aa27■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRM7 423 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf65H3BRN8 121 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF554Q86TJ5 538 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFESDQ8TAC1 157 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNK7Q9Y2U2 307 aa26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa26.98■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC7AQ9BXN2 247 aa26.98■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF21AQ96BD5 680 aa26.97■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf77C9JDV5 145 aa26.96■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF626Q68DY1 528 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa26.96■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ISOC1Q96CN7 298 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 POM121CA8CG34 1229 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFYBP25208 207 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOT12Q8WYK0 555 aa26.95■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0A6YYH2 397 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0U1RQK1 487 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NJ64 397 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODF3BA8MYP8 253 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPINT2O43291 252 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCF21O43680 179 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARG1P05089 322 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB112Q30KQ8 113 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF880Q6PDB4 577 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOB1BQ7L9L4 216 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD12Q8N2K0 398 aa26.95■■□□□ 1.9
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