RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.56□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 NEK7Q8TDX7 302 aa14.56□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 PHYHIPQ92561 330 aa14.56□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 PSG11Q9UQ72 335 aa14.56□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 FAM172BPA6NC97 362 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 PIN1P1O15428 100 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 HSPA13P48723 471 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 AQP4P55087 323 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 LYPD6Q86Y78 171 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 OR8H3Q8N146 312 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 RFESDQ8TAC1 157 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 TOMM40LQ969M1 308 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 CST11Q9H112 138 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.55□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 FBXO24O75426 580 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 MT-ND4P03905 459 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 FUT3P21217 361 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 MYF6P23409 242 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 RANBP1P43487 201 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 BLCAPP62952 87 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 SLC35A2P78381 396 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 C6orf183Q5T699 404 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 NRG4Q8WWG1 115 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 ARL11Q969Q4 196 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 DUSP21Q9H596 190 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.54□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1W2PP11 408 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 AIPO00170 330 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 SPINT2O43291 252 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 TSPAN15O95858 294 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 MGMTP16455 207 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 SSTR5P35346 364 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 IRF3Q14653 427 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 MED22Q15528 200 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 TRAM1Q15629 374 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 RAB12Q6IQ22 244 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 GAPTQ8N292 157 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 LINC00311Q8N616 119 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 ETAA1Q9NY74 926 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.53□□□□□ -0.08
COMMD4-218ENST00000567377 C15orf65H3BRN8 121 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 UFD1Q92890 307 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 Q96M66 194 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR5M11Q96RB7 305 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.52□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 RGS10O43665 173 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SC5DO75845 299 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SRMP19623 302 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 IL3RAP26951 378 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 DEFA6Q01524 100 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TPBGQ13641 420 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 LTC4SQ16873 150 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 STEAP3Q658P3 488 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TMED9Q9BVK6 235 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 BANF2Q9H503 90 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 LRRC42Q9Y546 428 aa14.51□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CCRL2O00421 344 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 PDCD6O75340 191 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OPN1MWP04001 364 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 LPLP06858 475 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 UCHL1P09936 223 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CD37P11049 281 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CD24P25063 80 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 GNG10P50151 68 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms