RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560553.1

MFGE8-213, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 4

Gene MFGE8, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-213ENST00000560553 DOC2BQ14184 412 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 AWAT2Q6E213 333 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 AHSA2Q719I0 299 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 LINC00596Q86U02 117 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 STX19Q8N4C7 294 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 ARL11Q969Q4 196 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 IFT22Q9H7X7 185 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 M0QZK8 103 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 AIPO00170 330 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 HSD17B6O14756 317 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 GPX5O75715 221 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 IGKV1D-33P01593 117 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 IGKV1-33P01594 117 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 CELP19835 753 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FSTP19883 344 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 TAS2R43P59537 309 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 CD83Q01151 205 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 PAX5Q02548 391 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 MPV17LQ2QL34 196 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 MOB3BQ86TA1 216 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF329Q86UD4 541 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 MYDGFQ969H8 173 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 CYYR1Q96J86 154 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 DERL3Q96Q80 235 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 BANF2Q9H503 90 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.23□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 COL7A1Q02388 2944 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 C15orf65H3BRN8 121 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 CCRL2O00421 344 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 PIN1P1O15428 100 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 PF4P02776 101 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 MT-ND4P03905 459 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 CD33P20138 364 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 VHLP40337 213 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 RAB7AP51149 207 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 WNT4P56705 351 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 GPR176Q14439 515 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 INSL4Q14641 139 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 RAB12Q6IQ22 244 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 OR8H3Q8N146 312 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 PRR18Q8N4B5 295 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 TMEM104Q8NE00 496 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 OR4K15Q8NH41 348 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 SGCDQ92629 289 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 ETAA1Q9NY74 926 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
MFGE8-213ENST00000560553 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 PSMB11A5LHX3 300 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 SERPINE3A8MV23 424 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 C12orf77C9JDV5 145 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 SLC31A2O15432 143 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 IGLL1P15814 213 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 MGMTP16455 207 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 GZMHP20718 246 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MFGE8-213ENST00000560553 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms