RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 TRAM1Q15629 374 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ZBTB6Q15916 424 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 BSXQ3C1V8 233 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CEACAM21Q3KPI0 293 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 LIN52Q52LA3 116 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ACTBL2Q562R1 376 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 HBMQ6B0K9 141 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 IGFL1Q6UW32 110 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CASP12Q6UXS9 341 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM25Q86YD3 366 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 PLCZ1Q86YW0 608 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 C12orf29Q8N999 325 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 OR8J2Q8NGG1 315 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 NAT14Q8WUY8 206 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 BLNKQ8WV28 456 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 DNAJC9Q8WXX5 260 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 BORCS5Q969J3 196 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 TAMM41Q96BW9 452 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 RMI2Q96E14 147 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 FMC1Q96HJ9 113 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 PPP1R36Q96LQ0 422 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SERPINB11Q96P15 392 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 C1orf50Q9BV19 199 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 KIFC1Q9BW19 673 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SCRT1Q9BWW7 348 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 BBS2Q9BXC9 721 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 DERL2Q9GZP9 239 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 OR52A5Q9H2C5 316 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 POMKQ9H5K3 350 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 C11orf49Q9H6J7 331 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 FAM60AQ9NP50 221 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ABCB9Q9NP78 766 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 PARP11Q9NR21 331 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 NRBP2Q9NSY0 501 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 TAS2R1Q9NYW7 299 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SNX24Q9Y343 169 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SMARCA4P51532 1647 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 FAM135BQ49AJ0 1406 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CLUHO75153 1309 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SEC16AO15027 2179 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 A0A1W2PRG6 482 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 PQLC2LA1A4F0 135 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 ITGB1BP1O14713 200 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 GYG2O15488 501 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 AQP9O43315 295 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CALUO43852 315 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 DCTN3O75935 186 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 S100A8P05109 93 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 GP1BAP07359 652 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SLC35E2BP0CK96 405 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SMIM6P0DI80 62 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 NQO1P15559 274 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CBR1P16152 277 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 S100PP25815 95 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CRABP1P29762 137 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SLC6A1P30531 599 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 UGT2B10P36537 528 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CRATP43155 626 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 MAGEA6P43360 314 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SLCO1A2P46721 670 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 GNG10P50151 68 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 RAB13P51153 203 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 XKP51811 444 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 OR2B6P58173 313 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 NAA20P61599 178 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 RBX1P62877 108 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CD164Q04900 197 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 BAXQ07812 192 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 TPBGQ13641 420 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 POU6F1Q14863 301 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 KCNJ8Q15842 424 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SSX1Q16384 188 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM241Q24JQ0 296 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 C5orf46Q6UWT4 87 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 CLEC18BQ6UXF7 455 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 FA2HQ7L5A8 372 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 SMIM15Q7Z3B0 74 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 GALNT10Q86SR1 603 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-205ENST00000558714 LINC00596Q86U02 117 aa1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 269.1 ms