RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PPE2	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PPH5	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PR64	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PRV1	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM77	I1YAP6	450 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SIGLEC5	O15389	551 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PAH	P00439	452 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TK1	P04183	234 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYBA1	P05813	215 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	LYL1	P12980	280 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CPT2	P23786	658 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	COX7A1	P24310	79 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CRHBP	P24387	322 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CFHR2	P36980	270 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PTGFR	P43088	359 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR3A4P	P47883	348 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	AES	Q08117	197 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	KLRD1	Q13241	179 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	INSL4	Q14641	139 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	LTC4S	Q16873	150 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	STUM	Q69YW2	141 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		Q8IYB0	196 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PNKD	Q8N490	385 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC107	Q8WV48	283 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SPSB1	Q96BD6	273 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM19	Q96E16	107 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	BANF2	Q9H503	90 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NOX4	Q9NPH5	578 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OPN4	Q9UHM6	478 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MEIOC	A2RUB1	952 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FUOM	A2VDF0	154 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		A8MXK9	166 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		K7N7A8	449 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRP	O00591	440 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FCN3	O75636	299 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	KDM4B	O94953	1096 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFB8	O95169	186 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	VENTX	O95231	258 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FSTL3	O95633	263 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2H2	O95918	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV1-69	P01742	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ALDOB	P05062	364 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL3L1	P16619	93 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SRM	P19623	302 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NFYB	P25208	207 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMB9	P28065	219 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CAV3	P56539	151 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ACTG1	P63261	375 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35A2	P78381	396 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PIGY	Q3MUY2	71 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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