RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	OPALIN	Q96PE5	141 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	GHITM	Q9H3K2	345 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	PARP11	Q9NR21	331 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CLN6	Q9NWW5	311 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		9.26	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	APOL3	O95236	402 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	OR5H8	P0DN80	308 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	FST	P19883	344 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	PITPNA	Q00169	270 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	IL17D	Q8TAD2	202 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	MBOAT4	Q96T53	435 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	TMED9	Q9BVK6	235 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		9.25	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	METTL15	A6NJ78	407 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	PRKACB	P22694	351 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	EPHA2	P29317	976 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ACTR3	P61158	418 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	RNLS	Q5VYX0	342 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	EME1	Q96AY2	570 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	C10orf35	Q96D05	121 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CYYR1	Q96J86	154 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		9.24	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	DEDD	O75618	318 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CST1	P01037	141 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	KRT8	P05787	483 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CRISP1	P54107	249 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	PAX5	Q02548	391 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	MMD	Q15546	238 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	PIGY	Q3MUY2	71 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	SPSB1	Q96BD6	273 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ADI1	Q9BV57	179 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	STUB1	Q9UNE7	303 aa		9.23	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PN81	502 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	FCN1	O00602	326 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A17	O43808	307 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	HLA-DRB1	P01911	266 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	MT-ND2	P03891	347 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNA7	P36544	502 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF137P	P52743	207 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	LSAMP	Q13449	338 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN26	Q16670	478 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ECSCR	Q19T08	205 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	TP53I3	Q53FA7	332 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC107	Q8WV48	283 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	ARL11	Q969Q4	196 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	RHOV	Q96L33	236 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	MS4A10	Q96PG2	267 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	TUBA4B	Q9H853	241 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	NEK6	Q9HC98	313 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		9.22	□□□□□ -0.93
BBS1-222	ENST00000533557	RGS11	O94810	467 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM225B	P0DP42	221 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	RAP2A	P10114	183 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	ACTB	P60709	375 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF85	Q03923	595 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
BBS1-222	ENST00000533557	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		9.21	□□□□□ -0.94

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