RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	ARL11	Q969Q4	196 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	CST11	Q9H112	138 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	VCX3B	Q9H321	246 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	SPINT2	O43291	252 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OPN1MW	P04001	364 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	LPL	P06858	475 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	MGMT	P16455	207 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	IL3RA	P26951	378 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR50	Q13585	617 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	SPHAR	Q15513	63 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	MED22	Q15528	200 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC107	Q8WV48	283 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	HSD17B6	O14756	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	CA11	O75493	328 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	MT-ND4	P03905	459 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	UBB	P0CG47	229 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM11	P17152	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	AQP4	P55087	323 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	UTF1	Q5T230	341 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393		Q6ZS46	218 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OR56B4	Q8NH76	319 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	TMED9	Q9BVK6	235 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	BANF2	Q9H503	90 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PPE3	182 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PPI3	338 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393		H0YHG0	523 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	CCRL2	O00421	344 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	PIN1P1	O15428	100 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	GLA	P06280	429 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FUT3	P21217	361 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393		Q3ZCU0	254 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	C1QL4	Q86Z23	238 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR18	Q8N4B5	295 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4K15	Q8NH41	348 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	UFD1	Q92890	307 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393		Q96M66	194 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.04	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms