RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 SCTP09683 121 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CDKN1AP38936 164 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GLP1RP43220 463 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GLIPR1P48060 266 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 EFNA4P52798 201 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 HLA-DRB3P79483 266 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RAB1CQ92928 201 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TIMD4Q96H15 378 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 COQ2Q96H96 371 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 LURAP1Q96LR2 239 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RELNP78509 3460 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ADAM20O43506 726 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PEX14O75381 377 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV2-70P01814 119 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RLN1P04808 185 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GZMHP20718 246 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 P2RX3P56373 397 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM33P57088 247 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RAB25P57735 213 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 EDDM3AQ14507 147 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 HMGN3Q15651 99 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 IGSF11Q5DX21 431 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 C6orf183Q5T699 404 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CHODLQ9H9P2 273 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DYSFO75923 2080 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ODAMA1E959 279 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 BET1O15155 118 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFB3O43676 98 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 LY6HO94772 140 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DIRAS3O95661 229 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SELLP14151 372 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FCGR2CP31995 323 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ECI1P42126 302 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NPY4RP50391 375 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 BCAP31P51572 246 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 EDDM3BP56851 147 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA4P78363 2273 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TATDN3Q17R31 274 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CR1LQ2VPA4 569 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 C14orf79Q96F83 325 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CCL19Q99731 98 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OPN4Q9UHM6 478 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CACNA1DQ01668 2161 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1B0GW55 424 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OR5H14A6NHG9 310 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 C12orf77C9JDV5 145 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SPINT2O43291 252 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PRAF2O60831 178 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.66□□□□□ -1.02
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