RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519365.1

UBR5-205, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-205	ENST00000519365	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	OR2H2	O95918	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PPY	P01298	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	CD8A	P01732	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ADH4	P08319	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SLC25A4	P12235	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	CXCL3	P19876	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PSMB6	P28072	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	IL2RG	P31785	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PIGP	P57054	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	FXYD4	P59646	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RND3	P61587	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	OR2F1	Q13607	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	MSMO1	Q15800	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RDH5	Q92781	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SNX22	Q96L94	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PRORY	Q9H606	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365		B9A039	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SIRPB1	O00241	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	HSPB6	O14558	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	MLNR	O43193	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SPRY3	O43610	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	NDUFA2	O43678	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	TSC22D2	O75157	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RHBDL1	O75783	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	WISP2	O76076	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SERPINE2	P07093	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	CD55	P08174	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	RPA2	P15927	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	AGA	P20933	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	S100A1	P23297	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	DUSP1	P28562	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	S100A11	P31949	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PRDX2	P32119	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SERPINF1	P36955	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	GABRA2	P47869	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	PAX5	Q02548	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	CD300C	Q08708	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	CATR1	Q13166	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	ZNF345	Q14585	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-205	ENST00000519365	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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