RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSP90B2PQ58FF3 399 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSX9Q7RTT3 188 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 NELFCDQ8IXH7 590 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCL17Q92583 94 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDIT4Q9NX09 232 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFL2Q9Y281 166 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-277P-201ENST00000516272 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 NRCAMQ92823 1304 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSBP1O75506 76 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV1D-12P01611 117 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPSAP08865 295 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTSEP14091 401 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLF1P58340 268 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 BEX5Q5H9J7 111 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CARD17Q5XLA6 110 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM42Q69YG0 159 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q8N2B8 174 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF439Q8NDP4 499 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR11H1Q8NG94 326 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PANX1Q96RD7 426 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A31Q9H0C2 315 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCNT4Q9P109 453 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANXA10Q9UJ72 324 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNURFQ9Y675 71 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOLGA8OA6NCC3 632 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGPA6NDG6 321 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM235A6NFC5 223 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOLGA8NF8WBI6 632 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A16P16260 332 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTF2H1P32780 548 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 P2RY2P41231 377 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTBP2P56545 445 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAD51Q06609 339 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPRG1LQ5T0D9 272 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARMC12Q5T9G4 340 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM122BQ7Z309 247 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 C10orf107Q8IVU9 208 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 DYNAPQ8N1N2 210 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAM1L1Q8N609 369 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 C8orf31Q8N9H6 132 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR5J2Q8NH18 312 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CASTOR1Q8WTX7 329 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 OPALINQ96PE5 141 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MND1Q9BWT6 205 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTCH2Q9Y6C9 303 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRIFINA4D1Z8 144 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9J4A7 227 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCF21O43680 179 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP55Q53EZ4 464 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LUZP2Q86TE4 346 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIH1D2Q8WWB5 315 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ISOC2Q96AB3 205 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANP32EQ9BTT0 268 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 COX16Q9P0S2 106 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 POMPQ9Y244 141 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCPQ6ZWJ8 1503 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED12LQ86YW9 2145 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBFOX3A6NFN3 312 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 K7EQS6 105 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYO1DO94832 1006 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GBE1Q04446 702 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 BSPH1Q075Z2 132 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASL11AQ6T310 242 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC35E3Q7Z769 313 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PQLC3Q8N755 202 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCUR1Q96AQ8 359 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHP1Q99653 195 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 UPK3BQ9BT76 320 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 NRBP2Q9NSY0 501 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 H7C2Y5 167 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 M0R1B8 84 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CA2P00918 260 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSTM3P21266 225 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFA6Q01524 100 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 LHFPL1Q86WI0 220 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR8D1Q8WZ84 308 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELOVL6Q9H5J4 265 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARMC7Q9H6L4 198 aa-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.1 ms