RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CITED1Q99966 193 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 DCTN5Q9BTE1 182 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 CHIAQ9BZP6 476 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 NKX6-3A6NJ46 265 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 SNURFLB1AK76 121 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 M0R1W7 72 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 SIGLEC5O15389 551 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 SELENOFO60613 162 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 FCN3O75636 299 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 CLPXO76031 633 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 IGLV3-1P01715 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 SLC2A5P22732 501 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ACKR3P25106 362 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2E1P51965 193 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ACTR3P61158 418 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ESRRGP62508 458 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 GNG3P63215 75 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 CSNK2BP67870 215 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 RNF170Q96K19 258 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 AMELYQ99218 206 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 TEAD3Q99594 435 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 CCL13Q99616 98 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 PKP2Q99959 881 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 THTPAQ9BU02 230 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 MROQ9BYG7 248 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 C16orf95Q9H693 158 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 MED20Q9H944 212 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 RASL12Q9NYN1 266 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 LAMP5Q9UJQ1 280 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-225ENST00000515835 DYSFO75923 2080 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 A0A0U1RQK1 487 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 BTBD17A6NE02 478 aa4.83□□□□□ -1.64
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PDE4D-225ENST00000515835 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 H7C423 109 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 GYG2O15488 501 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 FKBP6O75344 327 aa4.83□□□□□ -1.64
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PDE4D-225ENST00000515835 OMGP23515 440 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 TGFBR2P37173 567 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 CRISP1P54107 249 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 CBX1P83916 185 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 APOFQ13790 326 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 FLOT2Q14254 428 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 AANATQ16613 207 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 FAHD1Q6P587 224 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 C11orf88Q6PI97 169 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZRP5 223 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZSR3 168 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.83□□□□□ -1.64
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PDE4D-225ENST00000515835 FAM216BQ8N7L0 139 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 Q8N7P7 452 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 OR8B12Q8NGG6 310 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 LINC01006Q8NI28 216 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 TNFRSF14Q92956 283 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 SDSLQ96GA7 329 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 OR8B4Q96RC9 309 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 OR51I2Q9H344 312 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 FAM206AQ9NX38 181 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-225ENST00000515835 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.83□□□□□ -1.64
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