RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506401.6

ITGA3-207, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 1,817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-207ENST00000506401 HMGN3Q15651 99 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 LURAP1Q96LR2 239 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ODAMA1E959 279 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 OR5H14A6NHG9 310 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 RP2O75695 350 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DIRAS3O95661 229 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 SELLP14151 372 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 PGAM2P15259 253 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 GZMHP20718 246 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 FPR2P25090 351 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 CDKN1AP38936 164 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 KIRREL1Q96J84 757 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 GPR132Q9UNW8 380 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 COL12A1Q99715 3063 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1B0GW55 424 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 C7orf66A4D0T2 115 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ADAM20O43506 726 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 HERV-K104P61576 105 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 CBX3Q13185 183 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 HERPUD1Q15011 391 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 PRR18Q8N4B5 295 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TIMD4Q96H15 378 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 GHITMQ9H3K2 345 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DUX4Q9UBX2 424 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 LRRK2Q5S007 2527 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 FAM172BPA6NC97 362 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 RAB1CQ92928 201 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 GALMQ96C23 342 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 OR51J1Q9H342 316 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 C12orf77C9JDV5 145 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 HSPA12AO43301 675 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 NDUFB3O43676 98 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 LY6HO94772 140 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 NDUFB7P17568 137 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 AADACP22760 399 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 IL2RGP31785 369 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 EFNA4P52798 201 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TAS2R31P59538 309 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 C4orf46Q504U0 113 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 LIME1Q9H400 295 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 CHODLQ9H9P2 273 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 OPN4Q9UHM6 478 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 HMX3A6NHT5 357 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 SPINT2O43291 252 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 PPYP01298 95 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV2-70P01814 119 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 HBZP02008 142 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF728P0DKX0 622 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM33P57088 247 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 FXYD4P59646 89 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 TOMM40LQ969M1 308 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 ARL11Q969Q4 196 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 MOB3AQ96BX8 217 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 C14orf79Q96F83 325 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-207ENST00000506401 USF3Q68DE3 2245 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms