RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-222	ENST00000491843	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	PID1	Q7Z2X4	250 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CIB1	Q99828	191 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	POMP	Q9Y244	141 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	BTRC	Q9Y297	605 aa		0.96	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CACNA1S	Q13698	1873 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ARGFX	A6NJG6	315 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843		A8MWP6	167 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	STAG3L2	P0CL84	134 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	TSPO	P30536	169 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	VAMP3	Q15836	100 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	DCANP1	Q8TF63	244 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	MITD1	Q8WV92	249 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CDKL2	Q92772	493 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	APOL4	Q9BPW4	351 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	EBPL	Q9BY08	206 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	RMND1	Q9NWS8	449 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	STMN3	Q9NZ72	180 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CRB1	P82279	1406 aa		0.95	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843		A0A0J9YX75	114 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	IGSF23	A1L1A6	192 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843		F8VP50	259 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	UBD	O15205	165 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	OTC	P00480	354 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CPM	P14384	443 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF3	P17036	446 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	PYCR1	P32322	319 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CBX5	P45973	191 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	RAB25	P57735	213 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	OR8G5	Q8NG78	346 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	DTD1	Q8TEA8	209 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	COPS4	Q9BT78	406 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	BEX2	Q9BXY8	128 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM206A	Q9NX38	181 aa		0.94	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	FGF16	O43320	207 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	TRAPPC3	O43617	180 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	SC5D	O75845	299 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	IGKV1D-12	P01611	117 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	GZMB	P10144	247 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	MAGEA3	P43357	314 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF117	Q03924	483 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	HTR4	Q13639	388 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	HBM	Q6B0K9	141 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	GATD1	Q8NB37	220 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843		Q9BRP9	147 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		0.93	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	PTPRJ	Q12913	1337 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	GIMD1	P0DJR0	217 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	SPAM1	P38567	509 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	HSPA13	P48723	471 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ATP5J2	P56134	94 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843		Q6ZT83	130 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ERMN	Q8TAM6	284 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	UPK3B	Q9BT76	320 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		0.92	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	FNDC10	F2Z333	226 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843		J3QLI3	93 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	CDIPT	O14735	213 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	LYNX1	P0DP58	116 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	UGT2B10	P36537	528 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	MP68	P56378	58 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	HES3	Q5TGS1	186 aa		0.91	□□□□□ -2.26
ZNF638-222	ENST00000491843	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		0.91	□□□□□ -2.26

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