RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490178.1

CCZ1B-212, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 527 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-212ENST00000490178 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GFRALQ6UXV0 394 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 LURAP1Q96LR2 239 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 C2orf50Q96LR7 162 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PRORYQ9H606 182 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 NAA60Q9H7X0 242 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 BEX1Q9HBH7 125 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GLS2Q9UI32 602 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GAB2Q9UQC2 676 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 HSPB11Q9Y547 144 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.5□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CACNA1AO00555 2505 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PIEZO1Q92508 2521 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 LINC00862A6NCI5 91 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GOSR2O14653 212 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ZNF737O75373 536 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 AGFG2O95081 481 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 MPC2O95563 127 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CDS2O95674 445 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 OR2H2O95918 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 IFNA2P01563 188 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ZNF728P0DKX0 622 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PRKACAP17612 351 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CXCL2P19875 107 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 S100A1P23297 94 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GLRA1P23415 457 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 UCP1P25874 307 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PSMB6P28072 239 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GNRHRP30968 328 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 NPY4RP50391 375 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 HTD2P86397 168 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CLLU1Q5K131 121 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 DYRK2Q92630 601 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CYYR1Q96J86 154 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 C18orf12Q96KH6 178 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 NGBQ9NPG2 151 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 MEMO1Q9Y316 297 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 SVILO95425 2214 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 M0R233 179 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 GPR31O00270 319 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CDIPTO14735 213 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 IFNA7P01567 189 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PET100P0DJ07 73 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CGB3P0DN86 165 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 CGB7P0DN87 165 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 FCGR2CP31995 323 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 ASCL1P50553 236 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 FAM27E3Q08E93 113 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 KIR3DS1Q14943 382 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 OPCMLQ14982 345 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TSC22D1Q15714 1073 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 EFNB3Q15768 340 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 SLC22A25Q6T423 547 aa6.48□□□□□ -1.37
CCZ1B-212ENST00000490178 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.48□□□□□ -1.37
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