RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 HEXAP06865 529 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CD3EP07766 207 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CTXN2P0C2S0 81 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CGB3P0DN86 165 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CGB7P0DN87 165 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ANXA3P12429 323 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 PI3P19957 117 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 GNLYP22749 145 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 AADACP22760 399 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 PRDX2P32119 198 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 KIR2DS4P43632 304 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TAS2R31P59538 309 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 SELENOVP59797 346 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ARPC4P59998 168 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 HLA-DRB3P79483 266 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 KIR2DS1Q14954 304 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ZFP69Q49AA0 526 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 C4orf46Q504U0 113 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 BEX5Q5H9J7 111 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 RHOVQ96L33 236 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 PPYP01298 95 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 IGFBP2P18065 325 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 GMFBP60983 142 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 IFITM2Q01629 132 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 COL10A1Q03692 680 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 BAMBIQ13145 260 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 IL15RAQ13261 267 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 FAM209AQ5JX71 171 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 STUMQ69YW2 141 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 SDSLQ96GA7 329 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 RNF7Q9UBF6 113 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 OPN4Q9UHM6 478 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.06□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 B9A039 149 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 K7N7A8 449 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 SIX6O95475 246 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CLDN14O95500 239 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 IGLV2-14P01704 120 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CD8AP01732 235 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 WNT2P09544 360 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF728P0DKX0 622 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 AKR1C4P17516 323 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 VAMP1P23763 118 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 GNRHRP30968 328 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 RAP2BP61225 183 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 IL13RA1P78552 427 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TLE1Q04724 770 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 TESK1Q15569 626 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 FAM201AQ5SY85 155 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 NEK7Q8TDX7 302 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 ASB13Q8WXK3 278 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 GALNT14Q96FL9 552 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 SNX22Q96L94 193 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 HYLS1Q96M11 299 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 GLS2Q9UI32 602 aa8.05□□□□□ -1.12
ITGA6-210ENST00000475302 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms