RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 MAPK13O15264 365 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 STX6O43752 255 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MPZL2O60487 215 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TBCAO75347 108 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CD160O95971 181 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TRGC1P0CF51 173 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 RAB4AP20338 218 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MIPP30301 263 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 HOXA6P31267 233 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 XCL1P47992 114 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ETV1P50549 477 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 NUCB1Q02818 461 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IFFO1Q0D2I5 559 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SELENBP1Q13228 472 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SCARB2Q14108 478 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TTMPQ5BVD1 217 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 FAM27BQ5VT28 67 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TTC23Q5W5X9 447 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C17orf78Q8N4C9 275 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C12orf29Q8N999 325 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF675Q8TD23 568 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SMCR5Q8TEV8 140 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C22orf15Q8WYQ4 148 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MUCL1Q96DR8 90 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SERPINI1Q99574 410 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MGLLQ99685 303 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 GON7Q9BXV9 100 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ARV1Q9H2C2 271 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 THAP9Q9H5L6 903 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 NRBP2Q9NSY0 501 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 UNC13CQ8NB66 2214 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ATRQ13535 2644 aa-1.06□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TACC2O95359 2948 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PQD3 144 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IRGMA1A4Y4 181 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TSPAN11A1L157 253 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C2orf70A6NJV1 201 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 OR11H12B2RN74 326 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 F8W036 122 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 H3BT86 120 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 M0R2N4 97 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 M0R3G1 203 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 GPR31O00270 319 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 BHLHE40O14503 412 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 INE1O15225 51 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 FIBPO43427 364 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ALOX12BO75342 701 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SERPINA7P05543 415 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CRYBA1P05813 215 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IQCF3P0C7M6 154 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CT45A6P0DMU7 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CT45A5P0DMU8 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CT45A7P0DMV0 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SFTPCP11686 197 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 MYL9P24844 172 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 IFNGR2P38484 337 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 GPR1P46091 355 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CAMLGP49069 296 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CTBP2P56545 445 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 GBE1Q04446 702 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 DMTNQ08495 405 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF345Q14585 488 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 PSMD5Q16401 504 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 C4orf26Q17RF5 130 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 RPEL1Q2QD12 228 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 ACTBL2Q562R1 376 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 HSP90B2PQ58FF3 399 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CT45A1Q5HYN5 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC183Q5T5S1 534 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 NXNL2Q5VZ03 156 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM215Q68D42 235 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 EPGNQ6UW88 154 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 LYZL1Q6UWQ5 148 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00575Q6W349 94 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 GALNT10Q86SR1 603 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 SLC30A8Q8IWU4 369 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 OR11H2Q8NH07 326 aa-1.07□□□□□ -2.58
SHQ1-204ENST00000468347 CT45A3Q8NHU0 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms