RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF101Q8IZC7 436 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 OR52I1Q8NGK6 324 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 NANPQ8TBE9 248 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC7A6Q92536 515 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SPTSSAQ969W0 71 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF799Q96GE5 643 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 OR8B4Q96RC9 309 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TBX5Q99593 518 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 DOK1Q99704 481 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 MROQ9BYG7 248 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TTTY10Q9BZA0 68 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 NIPAL2Q9H841 368 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 FKBP14Q9NWM8 211 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF580Q9UK33 172 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 IKZF2Q9UKS7 526 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 LRRC42Q9Y546 428 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TACC2O95359 2948 aa4.76□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 DAPL1A0PJW8 107 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 METTL15A6NJ78 407 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 F5H5K5 113 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SULT1C4O75897 302 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 APOC1P02654 83 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 FCGR3AP08637 254 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ADRA2AP08913 450 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 LIMS3P0CW19 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 LIMS4P0CW20 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 MYL12AP19105 171 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 HNF1AP20823 631 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TUBG1P23258 451 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 CRHBPP24387 322 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 HSD11B1P28845 292 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 GLRXP35754 106 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 CX3CR1P49238 355 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 PRKXP51817 358 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 RIDAP52758 137 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ERVS71-1P61550 626 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 RPS23P62266 143 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ACTA2P62736 377 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ACTG2P63267 376 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC35A2P78381 396 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ST3GAL4Q11206 333 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 MED21Q13503 144 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 UBE2V2Q15819 145 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF544Q6NX49 715 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 DRAM2Q6UX65 266 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 AHSA2Q719I0 299 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SYS1Q8N2H4 156 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF786Q8N393 782 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF283Q8N7M2 679 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM80Q96HE8 168 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF649Q9BS31 505 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 DUSP21Q9H596 190 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF442Q9H7R0 627 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ESM1Q9NQ30 184 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TUBG2Q9NRH3 451 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 CA10Q9NS85 328 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM206AQ9NX38 181 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SCN3BQ9NY72 215 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.75□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 E7EQL1 145 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 H3BSA7 217 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 CDK1P06493 297 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TACSTD2P09758 323 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC2A1P11166 492 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 POU3F4P49335 361 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ETV1P50549 477 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 OR12D2P58182 307 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 GABARAPL2P60520 117 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 PPP1CBP62140 327 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 SNAI3Q3KNW1 292 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 TP53I3Q53FA7 332 aa4.74□□□□□ -1.65
PRPF4B-204ENST00000466185 LIPNQ5VXI9 398 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms