RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 GHRHP01286 108 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 HLA-DQB1P01920 261 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 MELTFP08582 738 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 CD3GP09693 182 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 PTHLHP12272 177 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 MMP9P14780 707 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 MNDAP41218 407 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 GLP1RP43220 463 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ERVFRD-1P60508 538 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ARF6P62330 175 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 MADCAM1Q13477 382 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 HACD4Q5VWC8 232 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 CNIH2Q6PI25 160 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF714Q96N38 554 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 WDFY2Q96P53 400 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 KPTNQ9Y664 436 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 MED13LQ71F56 2210 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PPH5 198 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 C17orf98A8MV24 154 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 C15orf65H3BRN8 121 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 CLPXO76031 633 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 RBP4P02753 201 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 FCGR3AP08637 254 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF728P0DKX0 622 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 TNFSF8P32971 234 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 SSTR5P35346 364 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ARFRP1Q13795 201 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 TBX15Q96SF7 602 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 Q9N2K0 584 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 CALYQ9NYX4 217 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-211ENST00000460176 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ACANP16112 2415 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 C12orf77C9JDV5 145 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ORC5O43913 435 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 MMP23AO75900 390 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 TOX4O94842 621 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 GZMHP20718 246 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 TALDO1P37837 337 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 GDNFP39905 211 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 DLX1P56177 255 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 GNG2P59768 71 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 PITPNAQ00169 270 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 HMGN3Q15651 99 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 C6orf183Q5T699 404 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 SETD6Q8TBK2 473 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 UPRTQ96BW1 309 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ABHD1Q96SE0 405 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 SOSTQ9BQB4 213 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 AUP1Q9Y679 476 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ABCA1O95477 2261 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 HIVEP1P15822 2718 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ZANQ9Y493 2812 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 MEIOCA2RUB1 952 aa8.38□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 F2RL2O00254 374 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms