RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460132.5

PLOD3-208, Transcript of procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, human

TSL 3

Gene PLOD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLOD3-208	ENST00000460132	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132		A0A1W2PPE3	182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132		H0YHG0	523 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	CD28	P10747	220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	MGMT	P16455	207 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	MNDA	P41218	407 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	GNG10	P50151	68 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	DEFA6	Q01524	100 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	MED22	Q15528	200 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	RPE	Q96AT9	228 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	AIP	O00170	330 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	ORC5	O43913	435 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	PEX14	O75381	377 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	OR2F2	O95006	317 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	AMY1A	P04745	511 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	AMY2A	P04746	511 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	MADCAM1	Q13477	382 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	GPR50	Q13585	617 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	LYG1	Q8N1E2	194 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132		Q96M66	194 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FBXO24	O75426	580 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SC5D	O75845	299 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	FUT3	P21217	361 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	LOXL3	P58215	753 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132		A0A1W2PPI3	338 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	RGS10	O43665	173 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	LPL	P06858	475 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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