RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MITD1Q8WV92 249 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOMM40LQ969M1 308 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR2A7Q96R45 310 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DYSFO75923 2080 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BET1O15155 118 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF728P0DKX0 622 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNASE1P24855 282 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LMO1P25800 156 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD80P33681 288 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFHR2P36980 270 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GLP1RP43220 463 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL13RA1P78552 427 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HLA-DRB3P79483 266 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL10A1Q03692 680 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM201AQ5SY85 155 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GAPTQ8N292 157 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MOB3AQ96BX8 217 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.24□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DSCAMO60469 2012 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LHBP01229 141 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPYP01298 95 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF224P0DH78 156 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSG2P11465 335 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ECI1P42126 302 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR3A1P47881 315 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAP2BP61225 183 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCL8P80075 99 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MST1LQ2TV78 715 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCTD9Q7L273 389 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DTX2Q86UW9 622 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBALD1Q8TB05 177 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q8TCH9 128 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COQ2Q96H96 371 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HYLS1Q96M11 299 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TREM2Q9NZC2 230 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF7Q9UBF6 113 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DBX1A6NMT0 343 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TUSC2O75896 110 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRDX2P32119 198 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR2DS4P43632 304 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UCP3P55916 312 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERV-K104P61576 105 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR2DS1Q14954 304 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C11orf88Q6PI97 169 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHB2Q99623 299 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GCM1Q9NP62 436 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OPN4Q9UHM6 478 aa8.22□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.21□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms