RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXE3Q13461 319 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL22Q53GT1 634 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOB3BQ86TA1 216 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA12Q8IW75 414 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF152Q8N8N0 203 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N9W7 124 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf36Q96KX1 117 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCL2Q99929 193 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMPAD1Q9NX62 359 aa10.32□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3QLW9 94 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPZL2O60487 215 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCGR1AP12314 374 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF19P17023 458 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGYQ3MUY2 71 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARP16Q8N5Y8 322 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5D14Q8NGL3 314 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCXQ9H320 206 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCOCQ9UIL1 159 aa10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRPO00591 440 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHATP28329 748 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFHR3Q02985 330 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FHL3Q13643 280 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00311Q8N616 119 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACBD7Q8N6N7 88 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPER1Q99527 375 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM192AQ9GZU8 254 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM118AQ9NWS6 357 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHDHQ9UQ10 334 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VDAC1P21796 283 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSU1Q15404 277 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A30Q5SVS4 291 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM104Q8NE00 496 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8NFD4 153 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10K1Q8NGX5 313 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S1PR3Q99500 378 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG8Q9BVK2 526 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM212A6NML5 194 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB3O15480 346 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOSP00540 346 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHG4P01861 327 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB3AP20336 220 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL3RAP26951 378 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD1BP29016 333 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA13P48723 471 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AQP4P55087 323 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEDAGQ5VYS4 303 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYS1Q8N2H4 156 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51A2Q8NGJ7 313 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52M1Q8NGK5 317 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.29□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STARD9Q9P2P6 4700 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C15orf65H3BRN8 121 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR3BO95264 441 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GZMHP20718 246 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMB8P28062 276 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALEQ14376 348 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASC10Q5T4H9 136 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF529Q6P280 563 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCL4Q6XD76 172 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHFPL3Q86UP9 236 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SATL1Q86VE3 508 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR11H1Q8NG94 326 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5AK2Q8NH90 309 aa10.28□□□□□ -0.76
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC7Q8TAX7 377 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms