RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SPACA3Q8IXA5 215 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT8Q8WV74 236 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZDHHC16Q969W1 377 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ABHD17AQ96GS6 310 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 WDFY2Q96P53 400 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2V2Q96R30 315 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR8B4Q96RC9 309 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PSENENQ9NZ42 101 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CXorf65A6NEN9 183 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 M0R135 149 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 XRCC2O43543 280 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LYZL6O75951 148 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SMIM13P0DJ93 91 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 IKZF1Q13422 519 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA45Q537H7 98 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 Q56UQ5 140 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 Q5BKY6 102 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR8G5Q8NG78 346 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NEUROG1Q92886 237 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF799Q96GE5 643 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TTTY12Q9BZ98 90 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FUT9Q9Y231 359 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PQD3 144 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR4C46A6NHA9 309 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HSD17B6O14756 317 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DHRS3O75911 302 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFB6O95139 128 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CSRP3P50461 194 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DAPP51397 102 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 WNT3P56703 355 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PMP22Q01453 160 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TCF15Q12870 199 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 IL13RA2Q14627 380 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PRSS45Q7RTY3 260 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FDCSPQ8NFU4 85 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HSD17B8Q92506 261 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF2Q99496 336 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MED20Q9H944 212 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 VAX2Q9UIW0 290 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 KLK13Q9UKR3 277 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SIGLEC5O15389 551 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFA2O43678 99 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF737O75373 536 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TUSC2O75896 110 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GHRHP01286 108 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DEFA4P12838 97 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.791e-6■■□□□ 12.9
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SHBQ15464 509 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 BATF2Q8N1L9 274 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SYS1Q8N2H4 156 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ISOC2Q96AB3 205 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 VSTM2LQ96N03 204 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms