RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389759.7

PKP4-202, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 4,443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-202ENST00000389759 DIRC3C9JPN6 131 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 LMX1BO60663 402 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PAFAH1B2P68402 229 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 GAMTQ14353 236 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 CARFQ8N187 725 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 DECR2Q9NUI1 292 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 NAGKQ9UJ70 344 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 C4orf51C9J302 202 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 CD99P14209 185 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 ZNF708P17019 499 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 LBX1P52954 281 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 EFNB1P98172 346 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 Q6ZS52 159 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 POC1AQ8NBT0 407 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 OR10D3Q8NH80 312 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 ZNF519Q8TB69 540 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 RARRES2Q99969 163 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 CCL2P13500 99 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PRF1P14222 555 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 HTR1DP28221 377 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 DMWDQ09019 674 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 OR5AL1P0C617 328 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 F2RP25116 425 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 ZP4Q12836 540 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 HES1Q14469 280 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 GABRG3Q99928 467 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 A0A0U1RQV5 110 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 A0A1B0GTQ1 180 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SLC22A20A6NK97 555 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PSG2P11465 335 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 BRS3P32247 399 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 RASL10BQ96S79 203 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 K7ERU9 68 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 ADAM11O75078 769 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SRD5A2P31213 254 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 GLIPR1P48060 266 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 ACER2Q5QJU3 275 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 P2RX4Q99571 388 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SCN4AP35499 1836 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SIAH2O43255 324 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 IFI6P09912 130 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 GNB1P62873 340 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 MESP2Q0VG99 397 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 PSG5Q15238 335 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TEX30Q5JUR7 227 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TMEM56Q96MV1 263 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-202ENST00000389759 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms