RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 WASHC3Q9Y3C0 194 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTCH2Q9Y6C9 303 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 FSIP2Q5CZC0 6907 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCN9AQ15858 1988 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF532Q9HCE3 1301 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 PGPA6NDG6 321 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFPL4AA6NLU0 287 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0QXV9 152 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCN2BO60939 215 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 GABRR2P28476 465 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKR1C3P42330 323 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 CBX5P45973 191 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM258P61165 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACTBL2Q562R1 376 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SSX7Q7RTT5 188 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2W3Q7Z3T1 314 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 MICU2Q8IYU8 434 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAPTQ8N292 157 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 BPIFA3Q9BQP9 254 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 C11orf70Q9BRQ4 267 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 MND1Q9BWT6 205 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 POTEKPQ9BYX7 375 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC25A31Q9H0C2 315 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 CST9LQ9H4G1 147 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-601P-201ENST00000384540 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CACNA1BQ00975 2339 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBFOX3A6NFN3 312 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 E7EWF7 191 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 K7EQS6 105 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLA2G10O15496 165 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYO1DO94832 1006 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLTPP55058 493 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CTBP2P56545 445 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAS2R60P59551 318 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPL31P62899 125 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC35B1P78383 322 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ULK3Q6PHR2 472 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 C10orf107Q8IVU9 208 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 FGF13Q92913 245 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q96M85 177 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MGLLQ99685 303 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 C16orf95Q9H693 158 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 HPCAL4Q9UM19 191 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 LAMA4Q16363 1823 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV41A0A0B4J266 112 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 C11orf86A6NJI1 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BP45 60 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERLIN1O75477 346 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 CA2P00918 260 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGKV1D-12P01611 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 C1QCP02747 245 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC25A16P16260 332 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF3P17036 446 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMCHP20382 165 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GTF2H1P32780 548 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS5P46782 204 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKR1C2P52895 323 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLO1Q04760 184 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFFO1Q0D2I5 559 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM42Q69YG0 159 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 OLIG3Q7RTU3 272 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC35E3Q7Z769 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 OFCC1Q8IZS5 231 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIML2Q8N7C3 387 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51A7Q8NH64 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIH1D2Q8WWB5 315 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM131CQ96AQ9 280 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 APOL4Q9BPW4 351 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TM6SF2Q9BZW4 377 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 DIABLOQ9NR28 239 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 AHSPQ9NZD4 102 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 POMPQ9Y244 141 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1W2PRF3 423 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1W2PRM7 423 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM235A6NFC5 223 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM250H0YL14 139 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BPC8 53 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-601P-201ENST00000384540 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms