RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359513.8

ATG13-201, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 4,348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-201ENST00000359513 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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ATG13-201ENST00000359513 NAAAQ02083 359 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 UBE2V2Q15819 145 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 TBR1Q16650 682 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 ERGIC1Q969X5 290 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 SLC35E1Q96K37 410 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG13-201ENST00000359513 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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ATG13-201ENST00000359513 RAB7AP51149 207 aa7.4□□□□□ -1.22
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ATG13-201ENST00000359513 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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ATG13-201ENST00000359513 COL10A1Q03692 680 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 IGFBP7Q16270 282 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 OR5B12Q96R08 314 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 ZNF716A6NP11 495 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 PPYP01298 95 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 S100PP25815 95 aa7.39□□□□□ -1.23
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ATG13-201ENST00000359513 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.39□□□□□ -1.23
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ATG13-201ENST00000359513 TMED6Q8WW62 240 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 SYNGR3O43761 229 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 PRF1P14222 555 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 CEACAM3P40198 252 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 PPT1P50897 306 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 ERVS71-1P61550 626 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 TLE4Q04727 773 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 GTF3C1Q12789 2109 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 PEA15Q15121 130 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG13-201ENST00000359513 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.38□□□□□ -1.23
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