RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TMEM50BP56557 158 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TAS2R46P59540 309 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PDZD11Q5EBL8 140 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GTF3C1Q12789 2109 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR6C6A6NF89 314 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GPR137BO60478 399 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 HLA-HP01893 362 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR3A4PP47883 348 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RAB35Q15286 201 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RARRES2Q99969 163 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 K7N7A8 449 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MPIG6BO95866 241 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF20P17024 532 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ERVFRD-1P60508 538 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 UBE2KP61086 200 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GPR157Q5UAW9 335 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR2T2Q6IF00 324 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RAB24Q969Q5 203 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SLC22A20A6NK97 555 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 HSD17B6O14756 317 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 CDC14BO60729 498 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 KNG1P01042 644 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 TRGC2P03986 189 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SERPINA2P20848 420 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SLC22A25Q6T423 547 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 EHFQ9NZC4 300 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 RELNP78509 3460 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 CYB5BO43169 146 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SFTPCP11686 197 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 IL2RGP31785 369 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 FAM189A2Q15884 450 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 DOK3Q7L591 496 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 A8MWP6 167 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 ECI1P42126 302 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 ARFRP1Q13795 201 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SMCO3A2RU48 225 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SCGB1D2O95969 90 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 MBPP02686 304 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 TRGC1P0CF51 173 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 GLIPR1P48060 266 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 DLK1P80370 383 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 Q6ZS92 163 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 OR8G5Q8NG78 346 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SSC4DQ8WTU2 575 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 EXTL1Q92935 676 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 APH1AQ96BI3 265 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 V9GYS6 101 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 PIEZO1Q92508 2521 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 TGOLN2O43493 480 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 LCATP04180 440 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 EDN3P14138 238 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 SPTSSAQ969W0 71 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX11-201ENST00000359238 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms