RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 STX12Q86Y82 276 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-201ENST00000355530 AP4M1O00189 453 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 F10P00742 488 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 HBE1P02100 147 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 OR8U8P0C7N1 319 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A6P12236 298 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 EPHA1P21709 976 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SRYQ05066 204 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF506Q5JVG8 444 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 PCSK4Q6UW60 755 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 PSMF1Q92530 271 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 A0A087WWC5 75 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SYNGR1O43759 233 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 DFFBO76075 338 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SYNGR4O95473 234 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ARR3P36575 388 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CLDN18P56856 261 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 RUNX1Q01196 453 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF154Q13106 437 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 HAGHQ16775 308 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SPINK14Q6IE38 97 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 OR2M7Q8NG81 312 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 MUCL1Q96DR8 90 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 OR2W1Q9Y3N9 320 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GU03 582 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TNFSF12O43508 249 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 PAX9P55771 341 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TAS2R30P59541 319 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 HLA-DRB3P79483 266 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ICAM4Q14773 271 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 OR10J5Q8NHC4 309 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 RAB39BQ96DA2 213 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CALHM2Q9HA72 323 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CD300LBA8K4G0 201 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 NXPH3O95157 252 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 WNT2P09544 360 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CABLES2Q9BTV7 478 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 OR5B21A6NL26 309 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 NQO2P16083 231 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF880Q6PDB4 577 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF573Q86YE8 665 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 APH1AQ96BI3 265 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 RAB40CQ96S21 281 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 DOCK10Q96BY6 2186 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 LRP5LA4QPB2 252 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 DEGS1O15121 323 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 NGFP01138 241 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINE2P07093 398 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2KP61086 200 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 PLP2Q04941 152 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNHIT1O43257 154 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 NEURL1O76050 574 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 FABP1P07148 127 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CELA3AP09093 270 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 KHDC3LQ587J8 217 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF429Q86V71 674 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZPBPQ9BS86 351 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.54■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0G2JRQ6 117 aa15.54■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.54■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TXNL1O43396 289 aa15.54■□□□□ 0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms