RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ST20Q9HBF5 79 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 MTCH1Q9NZJ7 389 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 HELTA6NFD8 242 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM20O43506 726 aa4.34□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 LGALS4P56470 323 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 H7C1H1 209 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 DHHO43323 396 aa4.32□□□□□ -1.72
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