RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345957.8

SNX16-201, Transcript of sorting nexin 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX16, Length 1,853 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16-201ENST00000345957 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 STOML3Q8TAV4 291 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 PRR7Q8TB68 274 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 ZFP57Q9NU63 452 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.74□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 BMP5P22003 454 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 CD200P41217 278 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 UCNP55089 124 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TMPRSS3P57727 454 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TP53RKQ96S44 253 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 IFNL4K9M1U5 179 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TMEM56Q96MV1 263 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 DUSP13Q9UII6 198 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 SVILO95425 2214 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 A0A0G2JNJ9 132 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 WNT9BO14905 357 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 DEDDO75618 318 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 FAM27E3Q08E93 113 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 HMGN3Q15651 99 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 Q9UFV3 132 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX16-201ENST00000345957 HSD17B6O14756 317 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 MSMPQ1L6U9 139 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SSX8Q7RTT4 187 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 BVESQ8NE79 360 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 KCNAB3O43448 404 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 RBPJQ06330 500 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SLC35G3Q8N808 338 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 LRRC29Q8WV35 223 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 APC2O95996 2303 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 MSGN1A6NI15 193 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 H0Y980 276 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 TAAR5O14804 337 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 PSPNO60542 156 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 CDS2O95674 445 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 UCP1P25874 307 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 CFHR2P36980 270 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SELENOVP59797 346 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 LRP11Q86VZ4 500 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 ZNF695Q8IW36 515 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SUN5Q8TC36 379 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 IL22RA2Q969J5 263 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX16-201ENST00000345957 SPIN2AQ99865 258 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms