RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 RAC1P63000 192 aa21.63■■□□□ 1.05
SENP3-201ENST00000321337 SLC25A24Q6NUK1 477 aa21.63■■□□□ 1.05
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SENP3-201ENST00000321337 AAED1Q7RTV5 226 aa21.63■■□□□ 1.05
SENP3-201ENST00000321337 C1orf87Q8N0U7 546 aa21.63■■□□□ 1.05
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SENP3-201ENST00000321337 COX6A1P12074 109 aa21.59■■□□□ 1.05
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SENP3-201ENST00000321337 M1APQ8TC57 530 aa21.58■■□□□ 1.05
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SENP3-201ENST00000321337 CLDN15P56746 228 aa21.58■■□□□ 1.04
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SENP3-201ENST00000321337 Q6ZS49 121 aa21.58■■□□□ 1.04
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SENP3-201ENST00000321337 ABHD3Q8WU67 409 aa21.58■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa21.57■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 CEBPZOSA8MTT3 80 aa21.57■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 B4DEV8 164 aa21.57■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 SYNGR1O43759 233 aa21.57■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 IGKV1-39P01597 117 aa21.57■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 IGKV1D-39P04432 117 aa21.57■■□□□ 1.04
SENP3-201ENST00000321337 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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