RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYRM1O43325 122 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF841Q6ZN19 808 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR18Q8N4B5 295 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR13A1Q8NGR1 328 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB9BQ9NP90 201 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAP1L6A6NFF2 107 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0QYG6 137 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G10O15496 165 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD74P04233 296 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEXAP06865 529 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSTT2P0CG29 244 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK10Q15131 360 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF554Q86TJ5 538 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4C16Q8NGL9 310 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDND2Q8NHS1 167 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARID1AO14497 2285 aa22.72■■□□□ 1.23
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPINT2O43291 252 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV2-5P01817 119 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A16P16260 332 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4A4PQ8NGN8 299 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCTN5Q9BTE1 182 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 EHFQ9NZC4 300 aa22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 VWC2LB2RUY7 222 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 DISC1C4P0D8 188 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCN3O75636 299 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCTP09683 121 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTXN2P0C2S0 81 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFX2P48378 723 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMGN3Q15651 99 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS21Q2M5E4 152 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL11Q969Q4 196 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00312Q9Y6C7 94 aa22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMY2AP04746 511 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL2RGP31785 369 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPAN5P62079 268 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAAP20Q6NZ36 180 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM17Q86X19 198 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL1F10Q8WWZ1 152 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALMQ96C23 342 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf77C9JDV5 145 aa22.69■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 Q5PR19 223 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAX1Q5SQQ9 334 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD276Q5ZPR3 534 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4D10Q8NGI6 311 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 CORO2AQ92828 525 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIRREL1Q96J84 757 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPN4Q9UHM6 478 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PPH5 198 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BET1O15155 118 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR56B4Q8NH76 319 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5H8P0DN80 308 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSTR5P35346 364 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMO4P61968 165 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM200BQ69YZ2 307 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS57Q6UWY2 283 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GINS4Q9BRT9 223 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R3Q9NYW6 316 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALYQ9NYX4 217 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC105371242A0A075B767 164 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARRDC1Q8N5I2 433 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1L1Q8NH94 360 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10J5Q8NHC4 309 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBALD1Q8TB05 177 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF714Q96N38 554 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRRT1Q99946 306 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf24Q7Z6I8 188 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51S1Q8NGJ8 323 aa22.66■■□□□ 1.22
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