RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MOGAT3Q86VF5 341 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 MCM3APO60318 1980 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A27PA6NNH2 459 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB1C2P0DMR2 95 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SEC16AO15027 2179 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF205O95201 554 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SSMEM1Q8WWF3 244 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF665Q9H7R5 613 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PIPOXQ9P0Z9 390 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ROM1Q03395 351 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF23A1L1A6 192 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PAGE4O60829 102 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PITX3O75364 302 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBA1P05813 215 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 B2MP61769 119 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SNX22Q96L94 193 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV34A0A0B4J273 112 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 VSIG10L2P0DP72 767 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GAMTQ14353 236 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 OR1L1Q8NH94 360 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF519Q8TB69 540 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 LPAR5Q9H1C0 372 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SRD5A3Q9H8P0 318 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 M0R2Z0 102 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A40Q8TBP6 338 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf1O96002 111 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-34P06331 123 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 C3AR1Q16581 482 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HIST3H3Q16695 136 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK7Q9Y2U2 307 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FCGR3AP08637 254 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 BRS3P32247 399 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SAP30LQ9HAJ7 183 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 PILRAQ9UKJ1 303 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 R4GN57 208 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 F5H697 171 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 NPY1RP25929 384 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SERF2P84101 59 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 PERPQ96FX8 193 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SYNGR1O43759 233 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FAM157CP0CG43 387 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 PSG2P11465 335 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ACP1P24666 158 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CD81P60033 236 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GABRA6Q16445 453 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SMOC1Q9H4F8 434 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 PITPNC1Q9UKF7 332 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 P01737 135 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 G6PCP35575 357 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HIKESHIQ53FT3 197 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 C1RLQ9NZP8 487 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 MMP9P14780 707 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TEPPQ6URK8 271 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FSCN3Q9NQT6 498 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087X0M5 115 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GX30 115 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HELTA6NFD8 242 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 GNG7O60262 68 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 DEDDO75618 318 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL2P19875 107 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 TCL1AP56279 114 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 RFLNBQ8N5W9 214 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf17Q8NAS9 161 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SMRP1Q8NCR6 262 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 IL9P15248 144 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 FUT5Q11128 374 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF716A6NP11 495 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS7P47929 136 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 RIGQ13278 110 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf174Q8IYL3 243 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 MSL2Q9HCI7 577 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK2P20155 84 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA6P31267 233 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1A2P50226 295 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF10Q5QP82 559 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 LYRM7Q5U5X0 104 aa18.42■□□□□ 0.54
CCSAP-201ENST00000284617 HARBI1Q96MB7 349 aa18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms