RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	COPZ2	Q9P299	210 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MIOX	Q9UGB7	285 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780		H3BUI4	141 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV2-5	P01817	119 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CD74	P04233	296 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CSN2	P05814	226 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	TAS2R19	P59542	299 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	AES	Q08117	197 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	ING3	Q9NXR8	418 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	AKAIN1	P0CW23	69 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	PLET1	Q6UQ28	207 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	GAPT	Q8N292	157 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	ETAA1	Q9NY74	926 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MGST3	O14880	152 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NDUFB3	O43676	98 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MT-ND4	P03905	459 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	TBP	P20226	339 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	EDDM3A	Q14507	147 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CD5L	O43866	347 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NAPSA	O96009	420 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	GLIPR1	P48060	266 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	KCNJ3	P48549	501 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	PAX5	Q02548	391 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	OR8B2	Q96RD0	313 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	MMP28	Q9H239	520 aa		18.47	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	FUOM	A2VDF0	154 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM157A	C9JC47	383 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CD3D	P04234	171 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NDUFB7	P17568	137 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	BCAP31	P51572	246 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	ARFRP1	Q13795	201 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	UPRT	Q96BW1	309 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	KIF25	Q9UIL4	384 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		18.46	■□□□□ 0.55
FAM53B-201	ENST00000280780	HIVEP2	P31629	2446 aa		18.46	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	18.45	■□□□□ 0.54	4e-9	■■■□□ 19
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	P2RX3	P56373	397 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	IFT46	Q9NQC8	304 aa		18.45	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	INAFM1	C9JVW0	142 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	TCRB	P04435	133 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	DTYMK	P23919	212 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	RAG2	P55895	527 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	TCF23	Q7RTU1	214 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	HOGA1	Q86XE5	327 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4K15	Q8NH41	348 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	SNAPC3	Q92966	411 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	C1orf159	Q96HA4	380 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	CLN8	Q9UBY8	286 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	EDDM3B	P56851	147 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	MEF2D	Q14814	521 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	ODAM	A1E959	279 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB3D	O95716	219 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	FCGR3A	P08637	254 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FAM53B-201	ENST00000280780	CCR6	P51684	374 aa		18.42	■□□□□ 0.54

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