RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 OR56B4Q8NH76 319 aa12.69□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF286AQ9HBT8 521 aa12.69□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 RETNQ9HD89 108 aa12.69□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 I3L521 148 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SULT1C4O75897 302 aa12.68□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 GPR12P47775 334 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 FUT6P51993 359 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF85Q03923 595 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A30Q5SVS4 291 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 OR52N4Q8NGI2 321 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 OR1N2Q8NGR9 330 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GGHQ92820 318 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SNX22Q96L94 193 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GON7Q9BXV9 100 aa12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 PSPNO60542 156 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 ENTPD6O75354 484 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 HAND1O96004 215 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GDNFP39905 211 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 NPBWR2P48146 333 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GNB1P62873 340 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 RUNX1Q01196 453 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 OR52W1Q6IF63 320 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC54Q8NEL0 328 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 OR10H4Q8NGA5 316 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 RFKQ969G6 155 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 MUL1Q969V5 352 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf35Q96D05 121 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 BORCS8Q96FH0 119 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TSC22D3Q99576 134 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GNB4Q9HAV0 340 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 CEPT1Q9Y6K0 416 aa12.67□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa12.66□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPI3 338 aa12.66□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 INMTO95050 263 aa12.66□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 FADS2O95864 444 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 ST3GAL4Q11206 333 aa12.66□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.66□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.66□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 CHST6Q9GZX3 395 aa12.66□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 DNAH2Q9P225 4427 aa12.65□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 BCL3P20749 454 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 CDK2P24941 298 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 PSMB9P28065 219 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 OR3A1P47881 315 aa12.65□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 HES1Q14469 280 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF146Q15072 292 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TP53I3Q53FA7 332 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 UTF1Q5T230 341 aa12.65□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 Q8IYB0 196 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 PP6455Q8WZ26 134 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 NABP2Q9BQ15 211 aa12.65□□□□□ -0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GNG8Q9UK08 70 aa12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SPCS1-201ENST00000233025 J3QRE1 110 aa12.64□□□□□ -0.39
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA12AO43301 675 aa12.64□□□□□ -0.39
SPCS1-201ENST00000233025 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP1P28562 367 aa12.64□□□□□ -0.39
SPCS1-201ENST00000233025 MAP2K4P45985 399 aa12.64□□□□□ -0.39
SPCS1-201ENST00000233025 TMBIM6P55061 237 aa12.64□□□□□ -0.39
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