RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 UCP1P25874 307 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IGFBP7Q16270 282 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PRR18Q8N4B5 295 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IL22RA2Q969J5 263 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.01□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 NKX2-6A6NCS4 301 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR5H1A6NKK0 313 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 WRBO00258 174 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ADAM20O43506 726 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TNFSF12O43508 249 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TNFSF13O75888 250 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 WISP2O76076 250 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IGLV1-44P01699 117 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SERPINE2P07093 398 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 KITLGP21583 273 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 NBL1P41271 181 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 VAMP2P63027 116 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 BLOC1S1P78537 153 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PCSK4Q6UW60 755 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 UBAC2Q8NBM4 344 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 STARD4Q96DR4 205 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 COQ3Q9NZJ6 369 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 KCNS2Q9ULS6 477 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 H0YL77 283 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MLNRO43193 412 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 KLK10O43240 276 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FBXO24O75426 580 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 F2RP25116 425 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SULT1A2P50226 295 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CAV2P51636 162 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 DEFA5Q01523 94 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SMIM21Q3B7S5 101 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PXDC1Q5TGL8 231 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 Q6ZS92 163 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR51H1Q8NH63 302 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ERGIC1Q969X5 290 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 DKK4Q9UBT3 224 aa7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 C3orf80F5H4A9 247 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FAM157CP0CG43 387 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF266Q14584 549 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR2C3Q8N628 320 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SMIM8Q96KF7 97 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 HRH4Q9H3N8 390 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 HES4Q9HCC6 221 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 SSSCA1O60232 199 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 CGAP01215 116 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 FABP6P51161 128 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 F2RL1P55085 397 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 HMGN3Q15651 99 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 NMSQ5H8A3 153 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 NINJ1Q92982 152 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC46Q96FV0 321 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 GPHA2Q96T91 129 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 TREM1Q9NP99 234 aa6.99□□□□□ -1.29
VAMP3-201ENST00000054666 PARP11Q9NR21 331 aa6.99□□□□□ -1.29
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